我國完成寨卡全基因組序列測定可用于藥物研發(fā)
摘要:軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所與相關(guān)單位密切合作,于2月21日直接從輸入性感染病例患者尿液中獲得寨卡病毒全基因組序列。
來源:科技日報
科技日報訊軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所與相關(guān)單位密切合作,于2月21日直接從輸入性感染病例患者尿液中獲得寨卡病毒全基因組序列。
據(jù)專家介紹,這是我國首次獲得寨卡病毒全基因組序列,也是全球首次直接從患者尿液中獲得病毒全基因組。該病毒基因組全長10.8kb,系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,屬于亞洲世系,與巴西、蘇里南、波多黎各等美洲國家流行毒株同源性為99.7%;核苷酸序列比對發(fā)現(xiàn)20個突變位點,其中5個突變位點導(dǎo)致氨基酸改變。
寨卡病毒全基因組序列的獲得,為病毒的溯源和進(jìn)化提供了重要證據(jù),可用于指導(dǎo)診斷試劑、疫苗和藥物的研發(fā)。同時,直接從患者尿液獲取病毒全基因組序列,解決了復(fù)雜臨床樣品中病原體高通量測序的技術(shù)難題,為臨床診療方案和出院標(biāo)準(zhǔn)的優(yōu)化提供了科學(xué)依據(jù)。
記者23日自中國疾控中心獲悉,中國疾控中心解析了中國首例輸入性寨卡病毒感染者的血樣,成功獲得病毒全基因組序列。
中國疾控中心病毒所所長李德新告訴記者,該病例血清標(biāo)本病毒載量極低,測序比較麻煩,中國疾控中心團隊和江西省疾控中心合作,采用2代高通量測序技術(shù),用2天時間完成了全基因組測序。病毒基因全長10676個堿基,遺傳進(jìn)化分析顯示與目前在美洲的流行株具有高度同源性。我國輸入性病例病毒全基因組序列的解析,對于我國輸入性病例的溯源、病毒變異、診斷試劑及疫苗等方面研究具有重要意義。
【所屬欄目:技術(shù)前沿】 【查看次數(shù):2927次】 【發(fā)布時間:2016年2月24日】